Menjadi program studi yang aktif mengkaji dan mengembangkan ilmu dan teknologi melalui kegiatan pembelajaran dan penelitian inovatif untuk menghasilkan sumberdaya manusia dan IPTEK unggul dalam bidang agroindustri berbasis benua maritim menjelang tahun 2025.
- Menyelenggarakan pendidikan yang bermutu dan mengembangkan IPTEK inovatif dalam bidang Agroindustri untuk membentuk lulusan Magister yang kompoten, profesional dan bertika akademik.
- Mengembangkan penelitian yang berkontribusi terhadap perkembangan IPTEK dan pemecahan masalah-masalah dalam bidang Agroindustri.
- Melaksanakan kegiatan pengabdian kepada Masyarakat dalam rangka penyebarluasan IPTEK dan hasil-hasil penelitian yang mendukung pengembangan Agroindustri di Indonesia.
- Menghasilkan akademisi, peneliti, praktisi, dan manajer profesional yang mampu merencanakan, menganalisis, mengimplementasikan dan mengevaluasi secara komprehensif melalui pendekatan inter dan multidisiplin dalam bidang Agroindustri.
- Menghasilkan penelitian terbaru dan publikasi ilmiah yang unggul dan inovatif untuk peningkatan nilai tambah produk dalam menunjang pembangunan bidang Agroindustri.
- Menerapkan dan menyebarluaskan IPTEK pada usaha di bidang Agroindustri baik skala kecil, menengah dan besar khususnya di kawasan Timur Indonesia.